بر اساس حکم رئیس جمهور برای رئیس دبیرخانه شورای عالی هماهنگی اقتصادی سران قوا، به‌نظر می‌رسد تشکیل یک دبیرخانه قوی مهمترین تغییر در این ساختار باشد که مسئولیت تشکیل آن به محسن رضایی سپرده شده است.